Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRBP23467 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRBP23467 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRBP23467 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRBP23467 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRBP23467 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRBP23467 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRBP23467 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRBP23467 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRBP23467 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRBP23467 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRBP23467 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRBP23467 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRBP23467 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRBP23467 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRBP23467 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRBP23467 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRBP23467 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRBP23467 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRBP23467 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRBP23467 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRBP23467 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRBP23467 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRBP23467 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRBP23467 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRBP23467 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRBP23467 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRBP23467 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRBP23467 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRBP23467 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRBP23467 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRBP23467 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRBP23467 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRBP23467 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRBP23467 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRBP23467 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRBP23467 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRBP23467 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRBP23467 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRBP23467 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRBP23467 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRBP23467 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRBP23467 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRBP23467 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRBP23467 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRBP23467 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRBP23467 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRBP23467 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRBP23467 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRBP23467 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRBP23467 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRBP23467 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRBP23467 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRBP23467 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRBP23467 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRBP23467 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRBP23467 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRBP23467 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRBP23467 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRBP23467 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRBP23467 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRBP23467 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRBP23467 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRBP23467 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRBP23467 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRBP23467 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRBP23467 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRBP23467 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRBP23467 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRBP23467 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRBP23467 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRBP23467 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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