Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCKDHBP21953 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCKDHBP21953 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BCKDHBP21953 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCKDHBP21953 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCKDHBP21953 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCKDHBP21953 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCKDHBP21953 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCKDHBP21953 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCKDHBP21953 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCKDHBP21953 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCKDHBP21953 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BCKDHBP21953 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCKDHBP21953 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCKDHBP21953 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCKDHBP21953 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCKDHBP21953 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCKDHBP21953 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCKDHBP21953 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCKDHBP21953 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCKDHBP21953 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCKDHBP21953 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BCKDHBP21953 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCKDHBP21953 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCKDHBP21953 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCKDHBP21953 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCKDHBP21953 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCKDHBP21953 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCKDHBP21953 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BCKDHBP21953 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCKDHBP21953 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCKDHBP21953 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCKDHBP21953 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCKDHBP21953 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCKDHBP21953 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCKDHBP21953 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCKDHBP21953 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCKDHBP21953 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCKDHBP21953 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCKDHBP21953 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCKDHBP21953 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BCKDHBP21953 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCKDHBP21953 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCKDHBP21953 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCKDHBP21953 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCKDHBP21953 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BCKDHBP21953 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCKDHBP21953 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCKDHBP21953 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCKDHBP21953 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCKDHBP21953 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCKDHBP21953 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCKDHBP21953 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCKDHBP21953 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
BCKDHBP21953 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BCKDHBP21953 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCKDHBP21953 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BCKDHBP21953 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BCKDHBP21953 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BCKDHBP21953 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCKDHBP21953 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCKDHBP21953 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCKDHBP21953 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCKDHBP21953 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCKDHBP21953 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms