Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXB8P17481 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXB8P17481 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
HOXB8P17481 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXB8P17481 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXB8P17481 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXB8P17481 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXB8P17481 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXB8P17481 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXB8P17481 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXB8P17481 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB8P17481 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB8P17481 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB8P17481 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB8P17481 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB8P17481 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB8P17481 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB8P17481 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXB8P17481 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXB8P17481 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB8P17481 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXB8P17481 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXB8P17481 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXB8P17481 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXB8P17481 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXB8P17481 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXB8P17481 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXB8P17481 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB8P17481 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB8P17481 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB8P17481 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXB8P17481 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXB8P17481 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB8P17481 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXB8P17481 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXB8P17481 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXB8P17481 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXB8P17481 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXB8P17481 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXB8P17481 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXB8P17481 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXB8P17481 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXB8P17481 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXB8P17481 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXB8P17481 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB8P17481 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB8P17481 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXB8P17481 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXB8P17481 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB8P17481 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB8P17481 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXB8P17481 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXB8P17481 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXB8P17481 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXB8P17481 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXB8P17481 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXB8P17481 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB8P17481 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB8P17481 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB8P17481 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB8P17481 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXB8P17481 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXB8P17481 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXB8P17481 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms