Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOXB3P14651 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB3P14651 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB3P14651 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB3P14651 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB3P14651 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB3P14651 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB3P14651 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB3P14651 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB3P14651 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB3P14651 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB3P14651 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB3P14651 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB3P14651 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB3P14651 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXB3P14651 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB3P14651 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB3P14651 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB3P14651 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB3P14651 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB3P14651 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB3P14651 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB3P14651 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB3P14651 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB3P14651 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXB3P14651 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXB3P14651 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXB3P14651 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXB3P14651 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXB3P14651 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXB3P14651 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXB3P14651 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXB3P14651 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXB3P14651 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB3P14651 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB3P14651 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB3P14651 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB3P14651 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB3P14651 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB3P14651 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB3P14651 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB3P14651 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXB3P14651 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB3P14651 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB3P14651 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB3P14651 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB3P14651 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB3P14651 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB3P14651 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB3P14651 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB3P14651 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB3P14651 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB3P14651 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB3P14651 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB3P14651 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB3P14651 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB3P14651 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB3P14651 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB3P14651 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB3P14651 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB3P14651 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms