Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRKCSHP14314 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRKCSHP14314 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRKCSHP14314 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRKCSHP14314 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRKCSHP14314 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRKCSHP14314 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRKCSHP14314 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRKCSHP14314 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRKCSHP14314 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRKCSHP14314 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRKCSHP14314 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRKCSHP14314 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRKCSHP14314 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRKCSHP14314 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PRKCSHP14314 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRKCSHP14314 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRKCSHP14314 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRKCSHP14314 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRKCSHP14314 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRKCSHP14314 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRKCSHP14314 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKCSHP14314 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKCSHP14314 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKCSHP14314 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKCSHP14314 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRKCSHP14314 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRKCSHP14314 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRKCSHP14314 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRKCSHP14314 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PRKCSHP14314 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRKCSHP14314 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRKCSHP14314 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRKCSHP14314 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKCSHP14314 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRKCSHP14314 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRKCSHP14314 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRKCSHP14314 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRKCSHP14314 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRKCSHP14314 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRKCSHP14314 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRKCSHP14314 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRKCSHP14314 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKCSHP14314 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKCSHP14314 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRKCSHP14314 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKCSHP14314 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKCSHP14314 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRKCSHP14314 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRKCSHP14314 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRKCSHP14314 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRKCSHP14314 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKCSHP14314 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKCSHP14314 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRKCSHP14314 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRKCSHP14314 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRKCSHP14314 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRKCSHP14314 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRKCSHP14314 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRKCSHP14314 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRKCSHP14314 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRKCSHP14314 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRKCSHP14314 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRKCSHP14314 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRKCSHP14314 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRKCSHP14314 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PRKCSHP14314 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRKCSHP14314 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRKCSHP14314 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms