Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC2BP0DI82 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC2BP0DI82 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC2BP0DI82 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC2BP0DI82 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC2BP0DI82 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC2BP0DI82 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC2BP0DI82 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC2BP0DI82 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC2BP0DI82 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC2BP0DI82 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC2BP0DI82 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC2BP0DI82 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC2BP0DI82 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC2BP0DI82 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC2BP0DI82 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC2BP0DI82 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC2BP0DI82 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC2BP0DI82 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC2BP0DI82 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC2BP0DI82 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC2BP0DI82 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC2BP0DI82 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC2BP0DI82 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC2BP0DI82 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC2BP0DI82 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC2BP0DI82 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC2BP0DI82 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC2BP0DI82 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC2BP0DI82 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC2BP0DI82 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC2BP0DI82 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC2BP0DI82 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC2BP0DI82 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC2BP0DI82 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC2BP0DI82 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC2BP0DI82 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC2BP0DI82 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC2BP0DI82 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC2BP0DI82 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC2BP0DI82 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC2BP0DI82 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC2BP0DI82 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC2BP0DI82 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC2BP0DI82 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC2BP0DI82 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC2BP0DI82 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC2BP0DI82 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC2BP0DI82 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC2BP0DI82 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2BP0DI82 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms