Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBBP0CG47 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBBP0CG47 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBBP0CG47 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBBP0CG47 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBBP0CG47 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBBP0CG47 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBBP0CG47 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBBP0CG47 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBBP0CG47 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBBP0CG47 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBBP0CG47 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBBP0CG47 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UBBP0CG47 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBBP0CG47 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBBP0CG47 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBBP0CG47 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBBP0CG47 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBBP0CG47 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBBP0CG47 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBBP0CG47 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBBP0CG47 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBBP0CG47 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBBP0CG47 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBBP0CG47 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBBP0CG47 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBBP0CG47 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBBP0CG47 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBBP0CG47 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBBP0CG47 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBBP0CG47 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBBP0CG47 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBBP0CG47 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBBP0CG47 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBBP0CG47 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBBP0CG47 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBBP0CG47 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBBP0CG47 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBBP0CG47 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBBP0CG47 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBBP0CG47 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBBP0CG47 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBBP0CG47 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBBP0CG47 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBBP0CG47 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBBP0CG47 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBBP0CG47 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBBP0CG47 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBBP0CG47 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBBP0CG47 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBBP0CG47 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBBP0CG47 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBBP0CG47 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBBP0CG47 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBBP0CG47 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBBP0CG47 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBBP0CG47 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBBP0CG47 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBBP0CG47 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms