Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAP2AP05549 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP2AP05549 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP2AP05549 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAP2AP05549 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAP2AP05549 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAP2AP05549 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFAP2AP05549 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFAP2AP05549 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFAP2AP05549 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFAP2AP05549 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFAP2AP05549 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFAP2AP05549 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFAP2AP05549 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAP2AP05549 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAP2AP05549 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAP2AP05549 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAP2AP05549 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFAP2AP05549 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFAP2AP05549 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFAP2AP05549 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFAP2AP05549 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFAP2AP05549 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFAP2AP05549 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFAP2AP05549 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFAP2AP05549 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFAP2AP05549 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFAP2AP05549 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAP2AP05549 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAP2AP05549 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAP2AP05549 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAP2AP05549 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFAP2AP05549 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFAP2AP05549 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFAP2AP05549 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAP2AP05549 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFAP2AP05549 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAP2AP05549 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAP2AP05549 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAP2AP05549 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFAP2AP05549 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAP2AP05549 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAP2AP05549 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAP2AP05549 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAP2AP05549 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFAP2AP05549 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFAP2AP05549 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFAP2AP05549 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFAP2AP05549 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFAP2AP05549 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFAP2AP05549 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFAP2AP05549 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFAP2AP05549 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFAP2AP05549 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFAP2AP05549 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFAP2AP05549 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TFAP2AP05549 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAP2AP05549 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFAP2AP05549 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFAP2AP05549 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms