Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYBBP04839 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYBBP04839 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYBBP04839 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYBBP04839 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYBBP04839 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYBBP04839 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYBBP04839 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYBBP04839 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYBBP04839 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYBBP04839 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYBBP04839 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYBBP04839 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYBBP04839 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYBBP04839 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYBBP04839 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYBBP04839 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYBBP04839 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYBBP04839 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYBBP04839 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYBBP04839 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CYBBP04839 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYBBP04839 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYBBP04839 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYBBP04839 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYBBP04839 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYBBP04839 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYBBP04839 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CYBBP04839 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYBBP04839 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYBBP04839 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYBBP04839 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYBBP04839 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYBBP04839 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYBBP04839 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYBBP04839 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CYBBP04839 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYBBP04839 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYBBP04839 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYBBP04839 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYBBP04839 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYBBP04839 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CYBBP04839 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYBBP04839 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYBBP04839 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYBBP04839 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYBBP04839 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYBBP04839 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYBBP04839 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYBBP04839 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYBBP04839 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYBBP04839 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYBBP04839 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYBBP04839 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYBBP04839 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYBBP04839 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYBBP04839 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYBBP04839 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYBBP04839 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYBBP04839 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYBBP04839 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYBBP04839 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYBBP04839 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYBBP04839 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYBBP04839 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYBBP04839 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYBBP04839 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYBBP04839 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYBBP04839 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CYBBP04839 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYBBP04839 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYBBP04839 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYBBP04839 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYBBP04839 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYBBP04839 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYBBP04839 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYBBP04839 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYBBP04839 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYBBP04839 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYBBP04839 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYBBP04839 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYBBP04839 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYBBP04839 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CYBBP04839 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYBBP04839 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CYBBP04839 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYBBP04839 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYBBP04839 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CYBBP04839 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYBBP04839 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYBBP04839 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CYBBP04839 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYBBP04839 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYBBP04839 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYBBP04839 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYBBP04839 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYBBP04839 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYBBP04839 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYBBP04839 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYBBP04839 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms