Protein–RNA interactions for Protein: P02787

TF, Serotransferrin, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFP02787 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFP02787 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFP02787 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFP02787 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFP02787 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFP02787 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TFP02787 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFP02787 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFP02787 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFP02787 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFP02787 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFP02787 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFP02787 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFP02787 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFP02787 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFP02787 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFP02787 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TFP02787 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFP02787 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFP02787 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFP02787 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFP02787 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFP02787 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFP02787 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFP02787 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFP02787 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFP02787 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFP02787 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFP02787 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFP02787 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFP02787 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFP02787 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFP02787 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFP02787 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFP02787 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFP02787 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFP02787 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFP02787 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFP02787 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFP02787 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFP02787 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFP02787 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFP02787 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFP02787 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFP02787 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFP02787 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFP02787 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFP02787 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFP02787 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFP02787 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFP02787 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFP02787 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFP02787 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TFP02787 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFP02787 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFP02787 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFP02787 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFP02787 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFP02787 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFP02787 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFP02787 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFP02787 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TFP02787 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFP02787 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFP02787 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFP02787 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFP02787 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFP02787 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFP02787 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFP02787 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFP02787 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFP02787 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFP02787 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFP02787 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFP02787 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFP02787 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFP02787 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TFP02787 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFP02787 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFP02787 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFP02787 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFP02787 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFP02787 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFP02787 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFP02787 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFP02787 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFP02787 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFP02787 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFP02787 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFP02787 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFP02787 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFP02787 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFP02787 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFP02787 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFP02787 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFP02787 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFP02787 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFP02787 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFP02787 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFP02787 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms