Protein–RNA interactions for Protein: O95755

RAB36, Ras-related protein Rab-36, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB36O95755 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB36O95755 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB36O95755 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB36O95755 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB36O95755 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB36O95755 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB36O95755 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB36O95755 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB36O95755 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB36O95755 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB36O95755 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB36O95755 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB36O95755 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB36O95755 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB36O95755 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB36O95755 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB36O95755 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB36O95755 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB36O95755 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB36O95755 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB36O95755 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB36O95755 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB36O95755 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB36O95755 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB36O95755 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB36O95755 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB36O95755 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB36O95755 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB36O95755 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB36O95755 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB36O95755 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB36O95755 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB36O95755 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAB36O95755 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB36O95755 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB36O95755 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB36O95755 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB36O95755 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB36O95755 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB36O95755 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB36O95755 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB36O95755 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB36O95755 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB36O95755 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB36O95755 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB36O95755 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB36O95755 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB36O95755 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB36O95755 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB36O95755 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB36O95755 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB36O95755 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB36O95755 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB36O95755 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB36O95755 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB36O95755 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB36O95755 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB36O95755 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB36O95755 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB36O95755 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB36O95755 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB36O95755 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB36O95755 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB36O95755 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB36O95755 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB36O95755 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB36O95755 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB36O95755 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB36O95755 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB36O95755 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB36O95755 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB36O95755 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB36O95755 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB36O95755 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB36O95755 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB36O95755 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB36O95755 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB36O95755 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB36O95755 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB36O95755 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB36O95755 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB36O95755 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB36O95755 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB36O95755 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB36O95755 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB36O95755 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB36O95755 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB36O95755 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB36O95755 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB36O95755 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB36O95755 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB36O95755 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB36O95755 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB36O95755 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB36O95755 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB36O95755 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB36O95755 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB36O95755 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB36O95755 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB36O95755 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms