Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
POLR1AO95602 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
POLR1AO95602 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
POLR1AO95602 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
POLR1AO95602 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
POLR1AO95602 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
POLR1AO95602 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
POLR1AO95602 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
POLR1AO95602 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.29■■■■■ 4.2
POLR1AO95602 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
POLR1AO95602 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
POLR1AO95602 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
POLR1AO95602 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
POLR1AO95602 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
POLR1AO95602 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
POLR1AO95602 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
POLR1AO95602 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
POLR1AO95602 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
POLR1AO95602 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
POLR1AO95602 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
POLR1AO95602 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
POLR1AO95602 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
POLR1AO95602 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
POLR1AO95602 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
POLR1AO95602 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
POLR1AO95602 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
POLR1AO95602 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
POLR1AO95602 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
POLR1AO95602 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
POLR1AO95602 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
POLR1AO95602 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
POLR1AO95602 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
POLR1AO95602 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
POLR1AO95602 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
POLR1AO95602 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
POLR1AO95602 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
POLR1AO95602 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
POLR1AO95602 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
POLR1AO95602 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
POLR1AO95602 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
POLR1AO95602 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
POLR1AO95602 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
POLR1AO95602 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
POLR1AO95602 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
POLR1AO95602 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
POLR1AO95602 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
POLR1AO95602 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
POLR1AO95602 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
POLR1AO95602 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
POLR1AO95602 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
POLR1AO95602 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
POLR1AO95602 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
POLR1AO95602 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
POLR1AO95602 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
POLR1AO95602 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
POLR1AO95602 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
POLR1AO95602 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
POLR1AO95602 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
POLR1AO95602 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
POLR1AO95602 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
POLR1AO95602 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
POLR1AO95602 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
POLR1AO95602 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
POLR1AO95602 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
POLR1AO95602 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
POLR1AO95602 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
POLR1AO95602 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
POLR1AO95602 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
POLR1AO95602 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
POLR1AO95602 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
POLR1AO95602 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
POLR1AO95602 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
POLR1AO95602 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
POLR1AO95602 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
POLR1AO95602 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
POLR1AO95602 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
POLR1AO95602 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
POLR1AO95602 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
POLR1AO95602 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
POLR1AO95602 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
POLR1AO95602 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
POLR1AO95602 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
POLR1AO95602 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
POLR1AO95602 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
POLR1AO95602 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
POLR1AO95602 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
POLR1AO95602 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
POLR1AO95602 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
POLR1AO95602 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
POLR1AO95602 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
POLR1AO95602 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
POLR1AO95602 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
POLR1AO95602 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLR1AO95602 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLR1AO95602 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLR1AO95602 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLR1AO95602 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
POLR1AO95602 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
POLR1AO95602 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
POLR1AO95602 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms