Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
PCF11O94913 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
PCF11O94913 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC44.37■■■■■ 4.69
PCF11O94913 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PCF11O94913 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PCF11O94913 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
PCF11O94913 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
PCF11O94913 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
PCF11O94913 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
PCF11O94913 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
PCF11O94913 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
PCF11O94913 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
PCF11O94913 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
PCF11O94913 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PCF11O94913 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
PCF11O94913 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
PCF11O94913 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
PCF11O94913 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PCF11O94913 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
PCF11O94913 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
PCF11O94913 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
PCF11O94913 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
PCF11O94913 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
PCF11O94913 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
PCF11O94913 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
PCF11O94913 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
PCF11O94913 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
PCF11O94913 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
PCF11O94913 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
PCF11O94913 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
PCF11O94913 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PCF11O94913 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PCF11O94913 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
PCF11O94913 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
PCF11O94913 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
PCF11O94913 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
PCF11O94913 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
PCF11O94913 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
PCF11O94913 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
PCF11O94913 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
PCF11O94913 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
PCF11O94913 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
PCF11O94913 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.8■■■■■ 4.6
PCF11O94913 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
PCF11O94913 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
PCF11O94913 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.74■■■■■ 4.59
PCF11O94913 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
PCF11O94913 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
PCF11O94913 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
PCF11O94913 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
PCF11O94913 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
PCF11O94913 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PCF11O94913 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
PCF11O94913 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
PCF11O94913 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
PCF11O94913 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
PCF11O94913 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
PCF11O94913 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
PCF11O94913 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
PCF11O94913 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PCF11O94913 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PCF11O94913 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
PCF11O94913 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.53■■■■■ 4.56
PCF11O94913 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
PCF11O94913 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PCF11O94913 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PCF11O94913 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
PCF11O94913 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PCF11O94913 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PCF11O94913 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
PCF11O94913 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
PCF11O94913 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
PCF11O94913 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
PCF11O94913 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
PCF11O94913 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
PCF11O94913 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PCF11O94913 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PCF11O94913 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PCF11O94913 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PCF11O94913 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
PCF11O94913 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
PCF11O94913 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
PCF11O94913 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
PCF11O94913 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
PCF11O94913 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
PCF11O94913 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
PCF11O94913 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
PCF11O94913 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
PCF11O94913 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
PCF11O94913 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
PCF11O94913 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
PCF11O94913 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
PCF11O94913 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
PCF11O94913 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
PCF11O94913 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PCF11O94913 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
PCF11O94913 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
PCF11O94913 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
PCF11O94913 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PCF11O94913 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms