Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP2O75563 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP2O75563 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP2O75563 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP2O75563 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKAP2O75563 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP2O75563 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SKAP2O75563 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP2O75563 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP2O75563 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKAP2O75563 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP2O75563 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP2O75563 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP2O75563 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKAP2O75563 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKAP2O75563 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP2O75563 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP2O75563 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP2O75563 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKAP2O75563 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKAP2O75563 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKAP2O75563 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP2O75563 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP2O75563 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKAP2O75563 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP2O75563 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP2O75563 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKAP2O75563 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP2O75563 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP2O75563 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP2O75563 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKAP2O75563 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SKAP2O75563 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKAP2O75563 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKAP2O75563 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKAP2O75563 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKAP2O75563 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP2O75563 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP2O75563 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP2O75563 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP2O75563 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP2O75563 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKAP2O75563 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP2O75563 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP2O75563 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP2O75563 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP2O75563 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKAP2O75563 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKAP2O75563 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP2O75563 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKAP2O75563 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKAP2O75563 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP2O75563 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP2O75563 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP2O75563 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP2O75563 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKAP2O75563 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKAP2O75563 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SKAP2O75563 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms