Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLX3O43711 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLX3O43711 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TLX3O43711 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TLX3O43711 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TLX3O43711 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TLX3O43711 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TLX3O43711 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TLX3O43711 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLX3O43711 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLX3O43711 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLX3O43711 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLX3O43711 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLX3O43711 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TLX3O43711 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TLX3O43711 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TLX3O43711 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TLX3O43711 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TLX3O43711 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TLX3O43711 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TLX3O43711 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TLX3O43711 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TLX3O43711 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TLX3O43711 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TLX3O43711 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TLX3O43711 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TLX3O43711 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TLX3O43711 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TLX3O43711 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TLX3O43711 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TLX3O43711 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TLX3O43711 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TLX3O43711 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TLX3O43711 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TLX3O43711 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TLX3O43711 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TLX3O43711 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TLX3O43711 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TLX3O43711 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TLX3O43711 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TLX3O43711 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLX3O43711 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLX3O43711 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TLX3O43711 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TLX3O43711 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLX3O43711 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLX3O43711 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLX3O43711 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TLX3O43711 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLX3O43711 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLX3O43711 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TLX3O43711 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TLX3O43711 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TLX3O43711 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TLX3O43711 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLX3O43711 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TLX3O43711 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TLX3O43711 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLX3O43711 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLX3O43711 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TLX3O43711 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TLX3O43711 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TLX3O43711 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TLX3O43711 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TLX3O43711 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TLX3O43711 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TLX3O43711 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TLX3O43711 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TLX3O43711 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLX3O43711 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLX3O43711 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TLX3O43711 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TLX3O43711 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TLX3O43711 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLX3O43711 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLX3O43711 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLX3O43711 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLX3O43711 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLX3O43711 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLX3O43711 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLX3O43711 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLX3O43711 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLX3O43711 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLX3O43711 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLX3O43711 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLX3O43711 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLX3O43711 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLX3O43711 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLX3O43711 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLX3O43711 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLX3O43711 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLX3O43711 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLX3O43711 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLX3O43711 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLX3O43711 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLX3O43711 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLX3O43711 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLX3O43711 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLX3O43711 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLX3O43711 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms