Protein–RNA interactions for Protein: O15234

CASC3, Protein CASC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3O15234 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC3O15234 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC3O15234 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC3O15234 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASC3O15234 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASC3O15234 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASC3O15234 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASC3O15234 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASC3O15234 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASC3O15234 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASC3O15234 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASC3O15234 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASC3O15234 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASC3O15234 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASC3O15234 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASC3O15234 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CASC3O15234 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASC3O15234 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASC3O15234 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASC3O15234 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC3O15234 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC3O15234 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC3O15234 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC3O15234 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC3O15234 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC3O15234 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC3O15234 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC3O15234 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC3O15234 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC3O15234 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC3O15234 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC3O15234 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC3O15234 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC3O15234 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC3O15234 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC3O15234 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASC3O15234 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASC3O15234 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC3O15234 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC3O15234 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC3O15234 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC3O15234 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC3O15234 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASC3O15234 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC3O15234 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASC3O15234 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC3O15234 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC3O15234 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC3O15234 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC3O15234 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC3O15234 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASC3O15234 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASC3O15234 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASC3O15234 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASC3O15234 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASC3O15234 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASC3O15234 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASC3O15234 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASC3O15234 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CASC3O15234 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CASC3O15234 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASC3O15234 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASC3O15234 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASC3O15234 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASC3O15234 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASC3O15234 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASC3O15234 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC3O15234 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC3O15234 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC3O15234 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASC3O15234 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CASC3O15234 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC3O15234 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC3O15234 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC3O15234 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC3O15234 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC3O15234 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC3O15234 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC3O15234 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC3O15234 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC3O15234 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASC3O15234 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASC3O15234 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC3O15234 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC3O15234 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC3O15234 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC3O15234 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC3O15234 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC3O15234 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC3O15234 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC3O15234 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC3O15234 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC3O15234 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC3O15234 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC3O15234 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC3O15234 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC3O15234 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC3O15234 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC3O15234 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC3O15234 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms