Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC50.01■■■■■ 5.6
CUX2O14529 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC50.01■■■■■ 5.6
CUX2O14529 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
CUX2O14529 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.98■■■■■ 5.59
CUX2O14529 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.96■■■■■ 5.59
CUX2O14529 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.96■■■■■ 5.59
CUX2O14529 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
CUX2O14529 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC49.95■■■■■ 5.59
CUX2O14529 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.59
CUX2O14529 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
CUX2O14529 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC49.9■■■■■ 5.58
CUX2O14529 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC49.9■■■■■ 5.58
CUX2O14529 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
CUX2O14529 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.88■■■■■ 5.58
CUX2O14529 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC49.88■■■■■ 5.57
CUX2O14529 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC49.83■■■■■ 5.57
CUX2O14529 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
CUX2O14529 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
CUX2O14529 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
CUX2O14529 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC49.78■■■■■ 5.56
CUX2O14529 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
CUX2O14529 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.74■■■■■ 5.55
CUX2O14529 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC49.67■■■■■ 5.54
CUX2O14529 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC49.67■■■■■ 5.54
CUX2O14529 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC49.64■■■■■ 5.54
CUX2O14529 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC49.63■■■■■ 5.53
CUX2O14529 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC49.63■■■■■ 5.53
CUX2O14529 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC49.63■■■■■ 5.53
CUX2O14529 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.61■■■■■ 5.53
CUX2O14529 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC49.58■■■■■ 5.53
CUX2O14529 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC49.57■■■■■ 5.53
CUX2O14529 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC49.54■■■■■ 5.52
CUX2O14529 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.51■■■■■ 5.52
CUX2O14529 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC49.5■■■■■ 5.52
CUX2O14529 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC49.5■■■■■ 5.52
CUX2O14529 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC49.5■■■■■ 5.52
CUX2O14529 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.47■■■■■ 5.51
CUX2O14529 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
CUX2O14529 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
CUX2O14529 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
CUX2O14529 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC49.39■■■■■ 5.5
CUX2O14529 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.38■■■■■ 5.5
CUX2O14529 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
CUX2O14529 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
CUX2O14529 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC49.31■■■■■ 5.48
CUX2O14529 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.3■■■■■ 5.48
CUX2O14529 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
CUX2O14529 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC49.28■■■■■ 5.48
CUX2O14529 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
CUX2O14529 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC49.25■■■■■ 5.48
CUX2O14529 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC49.23■■■■■ 5.47
CUX2O14529 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
CUX2O14529 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC49.18■■■■■ 5.46
CUX2O14529 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC49.17■■■■■ 5.46
CUX2O14529 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
CUX2O14529 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
CUX2O14529 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
CUX2O14529 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC49.15■■■■■ 5.46
CUX2O14529 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC49.14■■■■■ 5.46
CUX2O14529 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC49.13■■■■■ 5.46
CUX2O14529 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC49.11■■■■■ 5.45
CUX2O14529 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC49.1■■■■■ 5.45
CUX2O14529 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CUX2O14529 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
CUX2O14529 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.99■■■■■ 5.43
CUX2O14529 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC48.99■■■■■ 5.43
CUX2O14529 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
CUX2O14529 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.97■■■■■ 5.43
CUX2O14529 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
CUX2O14529 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
CUX2O14529 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.93■■■■■ 5.42
CUX2O14529 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC48.92■■■■■ 5.42
CUX2O14529 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC48.91■■■■■ 5.42
CUX2O14529 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
CUX2O14529 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC48.89■■■■■ 5.42
CUX2O14529 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC48.87■■■■■ 5.41
CUX2O14529 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
CUX2O14529 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
CUX2O14529 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
CUX2O14529 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
CUX2O14529 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
CUX2O14529 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
CUX2O14529 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC48.74■■■■■ 5.39
CUX2O14529 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.72■■■■■ 5.39
CUX2O14529 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
CUX2O14529 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
CUX2O14529 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC48.61■■■■■ 5.37
CUX2O14529 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
CUX2O14529 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC48.61■■■■■ 5.37
CUX2O14529 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
CUX2O14529 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
CUX2O14529 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC48.56■■■■■ 5.36
CUX2O14529 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC48.55■■■■■ 5.36
CUX2O14529 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
CUX2O14529 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC48.55■■■■■ 5.36
CUX2O14529 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC48.54■■■■■ 5.36
CUX2O14529 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC48.54■■■■■ 5.36
CUX2O14529 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC48.54■■■■■ 5.36
CUX2O14529 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC48.52■■■■■ 5.36
CUX2O14529 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
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