Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TK2O00142 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TK2O00142 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TK2O00142 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TK2O00142 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TK2O00142 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TK2O00142 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TK2O00142 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TK2O00142 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TK2O00142 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TK2O00142 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TK2O00142 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TK2O00142 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TK2O00142 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TK2O00142 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TK2O00142 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TK2O00142 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TK2O00142 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TK2O00142 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TK2O00142 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TK2O00142 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TK2O00142 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TK2O00142 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TK2O00142 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TK2O00142 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TK2O00142 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TK2O00142 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TK2O00142 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TK2O00142 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TK2O00142 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TK2O00142 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TK2O00142 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TK2O00142 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TK2O00142 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TK2O00142 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TK2O00142 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TK2O00142 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TK2O00142 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TK2O00142 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TK2O00142 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TK2O00142 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TK2O00142 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TK2O00142 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TK2O00142 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TK2O00142 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TK2O00142 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TK2O00142 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TK2O00142 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TK2O00142 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TK2O00142 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TK2O00142 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TK2O00142 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TK2O00142 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TK2O00142 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TK2O00142 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TK2O00142 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TK2O00142 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TK2O00142 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TK2O00142 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TK2O00142 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TK2O00142 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TK2O00142 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TK2O00142 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TK2O00142 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TK2O00142 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TK2O00142 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TK2O00142 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TK2O00142 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TK2O00142 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TK2O00142 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TK2O00142 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TK2O00142 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TK2O00142 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TK2O00142 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TK2O00142 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TK2O00142 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TK2O00142 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TK2O00142 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TK2O00142 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TK2O00142 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TK2O00142 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TK2O00142 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TK2O00142 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TK2O00142 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TK2O00142 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TK2O00142 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TK2O00142 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TK2O00142 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TK2O00142 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TK2O00142 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TK2O00142 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TK2O00142 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TK2O00142 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TK2O00142 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TK2O00142 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TK2O00142 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TK2O00142 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TK2O00142 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TK2O00142 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TK2O00142 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms