Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
H7C1D1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
H7C1D1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
H7C1D1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
H7C1D1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
H7C1D1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
H7C1D1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
H7C1D1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
H7C1D1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
H7C1D1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
H7C1D1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
H7C1D1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
H7C1D1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
H7C1D1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
H7C1D1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
H7C1D1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
H7C1D1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
H7C1D1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
H7C1D1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
H7C1D1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
H7C1D1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
H7C1D1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
H7C1D1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
H7C1D1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
H7C1D1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
H7C1D1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
H7C1D1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
H7C1D1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
H7C1D1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
H7C1D1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
H7C1D1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
H7C1D1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
H7C1D1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
H7C1D1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
H7C1D1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
H7C1D1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
H7C1D1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
H7C1D1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
H7C1D1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
H7C1D1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
H7C1D1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
H7C1D1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
H7C1D1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
H7C1D1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
H7C1D1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
H7C1D1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
H7C1D1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.81■■■■□ 3
H7C1D1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
H7C1D1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
H7C1D1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
H7C1D1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
H7C1D1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
H7C1D1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
H7C1D1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
H7C1D1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
H7C1D1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
H7C1D1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
H7C1D1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
H7C1D1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
H7C1D1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
H7C1D1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
H7C1D1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
H7C1D1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
H7C1D1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
H7C1D1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
H7C1D1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
H7C1D1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
H7C1D1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
H7C1D1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
H7C1D1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
H7C1D1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
H7C1D1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
H7C1D1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
H7C1D1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
H7C1D1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
H7C1D1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
H7C1D1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
H7C1D1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
H7C1D1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
H7C1D1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
H7C1D1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
H7C1D1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
H7C1D1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
H7C1D1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
H7C1D1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
H7C1D1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
H7C1D1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
H7C1D1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
H7C1D1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
H7C1D1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
H7C1D1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
H7C1D1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
H7C1D1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
H7C1D1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
H7C1D1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
H7C1D1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
H7C1D1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
H7C1D1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
H7C1D1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
H7C1D1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms