Protein–RNA interactions for Protein: H3BSH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSH0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BSH0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BSH0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BSH0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BSH0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BSH0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BSH0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BSH0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BSH0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BSH0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BSH0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BSH0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BSH0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BSH0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BSH0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BSH0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BSH0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BSH0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BSH0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BSH0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BSH0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BSH0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BSH0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BSH0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BSH0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BSH0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BSH0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BSH0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BSH0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BSH0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BSH0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BSH0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BSH0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BSH0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BSH0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BSH0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BSH0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BSH0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BSH0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H3BSH0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BSH0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BSH0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BSH0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BSH0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BSH0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BSH0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BSH0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BSH0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BSH0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BSH0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BSH0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BSH0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BSH0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BSH0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BSH0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BSH0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BSH0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BSH0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BSH0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BSH0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BSH0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BSH0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BSH0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BSH0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BSH0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BSH0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BSH0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BSH0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BSH0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BSH0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BSH0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BSH0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BSH0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BSH0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BSH0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BSH0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BSH0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BSH0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BSH0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BSH0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BSH0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BSH0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BSH0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BSH0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BSH0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BSH0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BSH0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BSH0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BSH0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H3BSH0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BSH0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BSH0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BSH0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BSH0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BSH0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BSH0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BSH0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BSH0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BSH0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BSH0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms