Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLRC4-KLRK1H3BQV0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLRC4-KLRK1H3BQV0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLRC4-KLRK1H3BQV0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLRC4-KLRK1H3BQV0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms