Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.2
E9PCH4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
E9PCH4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
E9PCH4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
E9PCH4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
E9PCH4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
E9PCH4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
E9PCH4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
E9PCH4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
E9PCH4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
E9PCH4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
E9PCH4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
E9PCH4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
E9PCH4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
E9PCH4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
E9PCH4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
E9PCH4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
E9PCH4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
E9PCH4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
E9PCH4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
E9PCH4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
E9PCH4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
E9PCH4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
E9PCH4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
E9PCH4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
E9PCH4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
E9PCH4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
E9PCH4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
E9PCH4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
E9PCH4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
E9PCH4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
E9PCH4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
E9PCH4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
E9PCH4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.15
E9PCH4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
E9PCH4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
E9PCH4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
E9PCH4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
E9PCH4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
E9PCH4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
E9PCH4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
E9PCH4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
E9PCH4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
E9PCH4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.76■■■■■ 4.12
E9PCH4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
E9PCH4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
E9PCH4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
E9PCH4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
E9PCH4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
E9PCH4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
E9PCH4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
E9PCH4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
E9PCH4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
E9PCH4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
E9PCH4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
E9PCH4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
E9PCH4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
E9PCH4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
E9PCH4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
E9PCH4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
E9PCH4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
E9PCH4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
E9PCH4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
E9PCH4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
E9PCH4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
E9PCH4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
E9PCH4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
E9PCH4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
E9PCH4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
E9PCH4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
E9PCH4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
E9PCH4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
E9PCH4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
E9PCH4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
E9PCH4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
E9PCH4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
E9PCH4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
E9PCH4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
E9PCH4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
E9PCH4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
E9PCH4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
E9PCH4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
E9PCH4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
E9PCH4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
E9PCH4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
E9PCH4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
E9PCH4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
E9PCH4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
E9PCH4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
E9PCH4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
E9PCH4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
E9PCH4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
E9PCH4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
E9PCH4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
E9PCH4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
E9PCH4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
E9PCH4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
E9PCH4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
E9PCH4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
E9PCH4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms