Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOBPA7XYQ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOBPA7XYQ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOBPA7XYQ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOBPA7XYQ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOBPA7XYQ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOBPA7XYQ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOBPA7XYQ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SOBPA7XYQ1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOBPA7XYQ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SOBPA7XYQ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOBPA7XYQ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOBPA7XYQ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOBPA7XYQ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOBPA7XYQ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOBPA7XYQ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOBPA7XYQ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOBPA7XYQ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOBPA7XYQ1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SOBPA7XYQ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SOBPA7XYQ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SOBPA7XYQ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOBPA7XYQ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOBPA7XYQ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOBPA7XYQ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOBPA7XYQ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOBPA7XYQ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SOBPA7XYQ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SOBPA7XYQ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SOBPA7XYQ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOBPA7XYQ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOBPA7XYQ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOBPA7XYQ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SOBPA7XYQ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SOBPA7XYQ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SOBPA7XYQ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOBPA7XYQ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SOBPA7XYQ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SOBPA7XYQ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SOBPA7XYQ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOBPA7XYQ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOBPA7XYQ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SOBPA7XYQ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOBPA7XYQ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SOBPA7XYQ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOBPA7XYQ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SOBPA7XYQ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOBPA7XYQ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOBPA7XYQ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOBPA7XYQ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SOBPA7XYQ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOBPA7XYQ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOBPA7XYQ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOBPA7XYQ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOBPA7XYQ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOBPA7XYQ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOBPA7XYQ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOBPA7XYQ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOBPA7XYQ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOBPA7XYQ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SOBPA7XYQ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOBPA7XYQ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOBPA7XYQ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOBPA7XYQ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOBPA7XYQ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOBPA7XYQ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOBPA7XYQ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SOBPA7XYQ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOBPA7XYQ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOBPA7XYQ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOBPA7XYQ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SOBPA7XYQ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOBPA7XYQ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOBPA7XYQ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SOBPA7XYQ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOBPA7XYQ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOBPA7XYQ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOBPA7XYQ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOBPA7XYQ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOBPA7XYQ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms