Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RTL1A6NKG5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RTL1A6NKG5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RTL1A6NKG5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RTL1A6NKG5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
RTL1A6NKG5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RTL1A6NKG5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RTL1A6NKG5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RTL1A6NKG5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RTL1A6NKG5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RTL1A6NKG5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RTL1A6NKG5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RTL1A6NKG5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RTL1A6NKG5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RTL1A6NKG5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RTL1A6NKG5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
RTL1A6NKG5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RTL1A6NKG5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RTL1A6NKG5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RTL1A6NKG5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
RTL1A6NKG5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RTL1A6NKG5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RTL1A6NKG5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RTL1A6NKG5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RTL1A6NKG5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RTL1A6NKG5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RTL1A6NKG5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RTL1A6NKG5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
RTL1A6NKG5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RTL1A6NKG5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RTL1A6NKG5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RTL1A6NKG5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
RTL1A6NKG5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RTL1A6NKG5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RTL1A6NKG5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RTL1A6NKG5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RTL1A6NKG5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RTL1A6NKG5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RTL1A6NKG5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RTL1A6NKG5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RTL1A6NKG5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RTL1A6NKG5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RTL1A6NKG5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RTL1A6NKG5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RTL1A6NKG5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RTL1A6NKG5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RTL1A6NKG5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RTL1A6NKG5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RTL1A6NKG5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RTL1A6NKG5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RTL1A6NKG5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RTL1A6NKG5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RTL1A6NKG5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RTL1A6NKG5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RTL1A6NKG5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RTL1A6NKG5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RTL1A6NKG5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RTL1A6NKG5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RTL1A6NKG5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RTL1A6NKG5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RTL1A6NKG5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RTL1A6NKG5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
RTL1A6NKG5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RTL1A6NKG5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RTL1A6NKG5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
RTL1A6NKG5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RTL1A6NKG5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RTL1A6NKG5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RTL1A6NKG5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RTL1A6NKG5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
RTL1A6NKG5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RTL1A6NKG5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RTL1A6NKG5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RTL1A6NKG5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RTL1A6NKG5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RTL1A6NKG5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37■■■■□ 3.51
RTL1A6NKG5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RTL1A6NKG5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTL1A6NKG5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTL1A6NKG5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTL1A6NKG5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RTL1A6NKG5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RTL1A6NKG5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RTL1A6NKG5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RTL1A6NKG5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
RTL1A6NKG5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RTL1A6NKG5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RTL1A6NKG5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RTL1A6NKG5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RTL1A6NKG5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RTL1A6NKG5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RTL1A6NKG5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
RTL1A6NKG5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RTL1A6NKG5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
RTL1A6NKG5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RTL1A6NKG5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RTL1A6NKG5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RTL1A6NKG5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RTL1A6NKG5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RTL1A6NKG5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms