Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
STRCP1A6NGW2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
STRCP1A6NGW2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
STRCP1A6NGW2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
STRCP1A6NGW2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
STRCP1A6NGW2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
STRCP1A6NGW2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
STRCP1A6NGW2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
STRCP1A6NGW2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
STRCP1A6NGW2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
STRCP1A6NGW2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
STRCP1A6NGW2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
STRCP1A6NGW2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
STRCP1A6NGW2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
STRCP1A6NGW2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
STRCP1A6NGW2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
STRCP1A6NGW2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
STRCP1A6NGW2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
STRCP1A6NGW2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
STRCP1A6NGW2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.06
STRCP1A6NGW2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
STRCP1A6NGW2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
STRCP1A6NGW2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
STRCP1A6NGW2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
STRCP1A6NGW2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
STRCP1A6NGW2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
STRCP1A6NGW2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
STRCP1A6NGW2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
STRCP1A6NGW2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
STRCP1A6NGW2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
STRCP1A6NGW2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
STRCP1A6NGW2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
STRCP1A6NGW2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
STRCP1A6NGW2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
STRCP1A6NGW2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
STRCP1A6NGW2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
STRCP1A6NGW2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
STRCP1A6NGW2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
STRCP1A6NGW2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
STRCP1A6NGW2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
STRCP1A6NGW2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
STRCP1A6NGW2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
STRCP1A6NGW2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
STRCP1A6NGW2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
STRCP1A6NGW2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
STRCP1A6NGW2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
STRCP1A6NGW2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
STRCP1A6NGW2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
STRCP1A6NGW2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
STRCP1A6NGW2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
STRCP1A6NGW2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
STRCP1A6NGW2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
STRCP1A6NGW2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
STRCP1A6NGW2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.04■■■■■ 4
STRCP1A6NGW2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
STRCP1A6NGW2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
STRCP1A6NGW2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
STRCP1A6NGW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
STRCP1A6NGW2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40■■■■□ 3.99
STRCP1A6NGW2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
STRCP1A6NGW2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
STRCP1A6NGW2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
STRCP1A6NGW2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
STRCP1A6NGW2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
STRCP1A6NGW2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
STRCP1A6NGW2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
STRCP1A6NGW2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
STRCP1A6NGW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.88■■■■□ 3.97
STRCP1A6NGW2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
STRCP1A6NGW2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
STRCP1A6NGW2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
STRCP1A6NGW2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
STRCP1A6NGW2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
STRCP1A6NGW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
STRCP1A6NGW2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
STRCP1A6NGW2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
STRCP1A6NGW2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
STRCP1A6NGW2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
STRCP1A6NGW2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
STRCP1A6NGW2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
STRCP1A6NGW2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
STRCP1A6NGW2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
STRCP1A6NGW2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
STRCP1A6NGW2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
STRCP1A6NGW2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
STRCP1A6NGW2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.67■■■■□ 3.94
STRCP1A6NGW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
STRCP1A6NGW2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
STRCP1A6NGW2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
STRCP1A6NGW2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
STRCP1A6NGW2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
STRCP1A6NGW2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
STRCP1A6NGW2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
STRCP1A6NGW2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
STRCP1A6NGW2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
STRCP1A6NGW2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
STRCP1A6NGW2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
STRCP1A6NGW2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
STRCP1A6NGW2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
STRCP1A6NGW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms