Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD3L3A6NE82 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD3L3A6NE82 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3L3A6NE82 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3L3A6NE82 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3L3A6NE82 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3L3A6NE82 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3L3A6NE82 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3L3A6NE82 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3L3A6NE82 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3L3A6NE82 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3L3A6NE82 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3L3A6NE82 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3L3A6NE82 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3L3A6NE82 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD3L3A6NE82 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD3L3A6NE82 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3L3A6NE82 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3L3A6NE82 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3L3A6NE82 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3L3A6NE82 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3L3A6NE82 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3L3A6NE82 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3L3A6NE82 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3L3A6NE82 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3L3A6NE82 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD3L3A6NE82 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD3L3A6NE82 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD3L3A6NE82 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3L3A6NE82 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3L3A6NE82 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3L3A6NE82 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3L3A6NE82 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3L3A6NE82 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3L3A6NE82 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3L3A6NE82 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3L3A6NE82 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3L3A6NE82 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3L3A6NE82 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3L3A6NE82 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3L3A6NE82 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3L3A6NE82 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3L3A6NE82 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3L3A6NE82 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3L3A6NE82 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3L3A6NE82 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3L3A6NE82 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3L3A6NE82 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3L3A6NE82 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3L3A6NE82 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3L3A6NE82 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3L3A6NE82 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3L3A6NE82 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3L3A6NE82 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3L3A6NE82 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3L3A6NE82 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3L3A6NE82 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD3L3A6NE82 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3L3A6NE82 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3L3A6NE82 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3L3A6NE82 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3L3A6NE82 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3L3A6NE82 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3L3A6NE82 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3L3A6NE82 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3L3A6NE82 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3L3A6NE82 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD3L3A6NE82 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3L3A6NE82 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3L3A6NE82 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3L3A6NE82 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3L3A6NE82 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3L3A6NE82 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3L3A6NE82 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms