Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC189A1A4V9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC189A1A4V9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC189A1A4V9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC189A1A4V9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC189A1A4V9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC189A1A4V9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC189A1A4V9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC189A1A4V9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC189A1A4V9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC189A1A4V9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC189A1A4V9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC189A1A4V9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC189A1A4V9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC189A1A4V9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC189A1A4V9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC189A1A4V9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC189A1A4V9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC189A1A4V9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC189A1A4V9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC189A1A4V9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC189A1A4V9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC189A1A4V9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC189A1A4V9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC189A1A4V9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC189A1A4V9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC189A1A4V9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC189A1A4V9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC189A1A4V9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC189A1A4V9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC189A1A4V9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC189A1A4V9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC189A1A4V9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC189A1A4V9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC189A1A4V9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC189A1A4V9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC189A1A4V9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC189A1A4V9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC189A1A4V9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC189A1A4V9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC189A1A4V9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC189A1A4V9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC189A1A4V9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC189A1A4V9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC189A1A4V9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC189A1A4V9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC189A1A4V9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC189A1A4V9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC189A1A4V9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC189A1A4V9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC189A1A4V9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC189A1A4V9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC189A1A4V9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC189A1A4V9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms