Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM129A0AVI4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM129A0AVI4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM129A0AVI4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM129A0AVI4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM129A0AVI4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM129A0AVI4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM129A0AVI4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM129A0AVI4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM129A0AVI4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM129A0AVI4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM129A0AVI4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM129A0AVI4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM129A0AVI4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM129A0AVI4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM129A0AVI4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM129A0AVI4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM129A0AVI4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM129A0AVI4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM129A0AVI4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM129A0AVI4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM129A0AVI4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM129A0AVI4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM129A0AVI4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM129A0AVI4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM129A0AVI4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM129A0AVI4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM129A0AVI4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM129A0AVI4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM129A0AVI4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM129A0AVI4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM129A0AVI4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM129A0AVI4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM129A0AVI4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM129A0AVI4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM129A0AVI4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM129A0AVI4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM129A0AVI4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM129A0AVI4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM129A0AVI4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM129A0AVI4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM129A0AVI4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM129A0AVI4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM129A0AVI4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM129A0AVI4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM129A0AVI4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms