Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVG6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVG6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GVG6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1B0GVG6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GVG6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GVG6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GVG6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1B0GVG6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1B0GVG6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1B0GVG6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1B0GVG6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A1B0GVG6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1B0GVG6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1B0GVG6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1B0GVG6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1B0GVG6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1B0GVG6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1B0GVG6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1B0GVG6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1B0GVG6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1B0GVG6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1B0GVG6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1B0GVG6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1B0GVG6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1B0GVG6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVG6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GVG6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVG6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVG6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVG6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVG6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVG6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVG6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVG6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1B0GVG6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1B0GVG6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1B0GVG6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1B0GVG6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A1B0GVG6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1B0GVG6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1B0GVG6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GVG6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GVG6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GVG6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GVG6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GVG6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GVG6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1B0GVG6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A1B0GVG6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1B0GVG6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1B0GVG6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1B0GVG6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1B0GVG6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1B0GVG6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1B0GVG6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1B0GVG6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1B0GVG6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1B0GVG6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1B0GVG6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A1B0GVG6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1B0GVG6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GVG6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GVG6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GVG6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GVG6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms