Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3KBP1Q96B97 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms