Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms