Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 RPL23-201ENST00000245857 588 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 44.5
SF3B4Q15427 RPL23-206ENST00000479035 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 44.5
SF3B4Q15427 RPL23-210ENST00000584583 429 ntTSL 27.01□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 44.5
SF3B4Q15427 HSPG2-212ENST00000493940 584 ntTSL 511.33□□□□□ -0.63e-10■■■■■ 44.5
SF3B4Q15427 DCXR-209ENST00000579155 430 ntTSL 516.65■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 MIIP-205ENST00000478749 779 ntTSL 213.65□□□□□ -0.225e-8■■■■■ 44.4
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SF3B4Q15427 DCAF11-234ENST00000561001 545 ntTSL 417.59■□□□□ 0.414e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 DCAF11-238ENST00000561375 748 ntTSL 316.44■□□□□ 0.224e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 DCAF11-233ENST00000560901 603 ntTSL 315.62■□□□□ 0.094e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 DCAF11-228ENST00000560171 590 ntTSL 314.96□□□□□ -0.014e-9■■■■■ 44.4
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SF3B4Q15427 DCAF11-235ENST00000561016 522 ntTSL 414.81□□□□□ -0.044e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 DCAF11-232ENST00000560713 543 ntTSL 414.56□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 DCAF11-221ENST00000559382 549 ntTSL 514.56□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 44.4
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SF3B4Q15427 DCAF11-213ENST00000558638 581 ntTSL 412.88□□□□□ -0.354e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 DCAF11-206ENST00000557809 568 ntTSL 411.81□□□□□ -0.524e-9■■■■■ 44.4
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SF3B4Q15427 DCAF11-225ENST00000559593 575 ntTSL 411.28□□□□□ -0.64e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 DCAF11-230ENST00000560459 587 ntTSL 49.82□□□□□ -0.844e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 DCAF11-214ENST00000558706 641 ntTSL 49.82□□□□□ -0.844e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 DCAF11-223ENST00000559451 659 ntTSL 59.81□□□□□ -0.844e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 DCAF11-236ENST00000561041 570 ntTSL 39.45□□□□□ -0.94e-9■■■■■ 44.4
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SF3B4Q15427 DCAF11-219ENST00000559288 575 ntTSL 48.09□□□□□ -1.114e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.056e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.086e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 BRCC3-204ENST00000369462 2846 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.856e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 BRCC3-207ENST00000411985 688 ntTSL 58.36□□□□□ -1.076e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 BRCC3-206ENST00000399042 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.126e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 BRCC3-210ENST00000630295 954 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.126e-9■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.166e-9■■■■■ 44.4
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SF3B4Q15427 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.476e-9■■■■■ 44.4
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SF3B4Q15427 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.653e-8■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 ARFGAP1-204ENST00000395285 2697 ntTSL 216.88■□□□□ 0.294e-15■■■■■ 44.4
SF3B4Q15427 PBXIP1-204ENST00000490230 853 ntTSL 517.28■□□□□ 0.367e-7■■■■■ 44.3
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SF3B4Q15427 ZUFSP-204ENST00000485498 807 ntTSL 24.76□□□□□ -1.653e-19■■■■■ 44.2
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SF3B4Q15427 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 44.1
SF3B4Q15427 PPOX-217ENST00000539753 816 ntTSL 513.32□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 44.1
SF3B4Q15427 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 44.1
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SF3B4Q15427 PPOX-206ENST00000466452 784 ntTSL 28.55□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 44.1
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SF3B4Q15427 TBC1D9B-219ENST00000524222 927 ntTSL 59.64□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 44.1
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SF3B4Q15427 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.237e-39■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.077e-39■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MTG1-202ENST00000432508 953 ntTSL 215.06■□□□□ 07e-39■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MTG1-203ENST00000460848 2730 ntTSL 213.58□□□□□ -0.247e-39■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MTG1-206ENST00000492266 413 ntTSL 29.78□□□□□ -0.847e-39■■■■■ 44
SF3B4Q15427 SCRN2-213ENST00000584567 932 ntTSL 217.63■□□□□ 0.414e-9■■■■■ 44
SF3B4Q15427 PLCG1-212ENST00000492148 597 ntTSL 212.34□□□□□ -0.435e-24■■■■■ 44
SF3B4Q15427 RPL9-209ENST00000511075 1028 ntTSL 25.29□□□□□ -1.567e-11■■■■■ 44
SF3B4Q15427 RPL9-202ENST00000437992 579 ntTSL 44.38□□□□□ -1.717e-11■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.171e-10■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-10■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-10■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-10■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-10■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 44
SF3B4Q15427 SIRT1-205ENST00000473922 576 ntTSL 421.65■■□□□ 1.065e-13■■■■■ 44
SF3B4Q15427 SFSWAP-204ENST00000535399 778 ntTSL 220.51■□□□□ 0.875e-13■■■■■ 44
SF3B4Q15427 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.385e-13■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.015e-13■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.115e-13■■■■■ 44
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