RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473922.1

SIRT1-205, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

TSL 4

Gene SIRT1, Length 576 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-205ENST00000473922 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.69■■■■■ 6.83
SIRT1-205ENST00000473922 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.21■■■■■ 5.79
SIRT1-205ENST00000473922 ABCC9O60706 1549 aa49.88■■■■■ 5.58
SIRT1-205ENST00000473922 NACADO15069 1562 aa48.13■■■■■ 5.29
SIRT1-205ENST00000473922 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.13■■■■■ 5.29
SIRT1-205ENST00000473922 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.11■■■■■ 5.29
SIRT1-205ENST00000473922 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.07■■■■■ 5.29
SIRT1-205ENST00000473922 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.93■■■■■ 5.26
SIRT1-205ENST00000473922 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.79■■■■■ 5.24
SIRT1-205ENST00000473922 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.99■■■■■ 5.11
SIRT1-205ENST00000473922 SCRIBQ14160 1630 aa46.67■■■■■ 5.06
SIRT1-205ENST00000473922 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.66■■■■■ 5.06
SIRT1-205ENST00000473922 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.64■■■■■ 5.06
SIRT1-205ENST00000473922 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.23■■■■■ 4.99
SIRT1-205ENST00000473922 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.64■■■■■ 4.9
SIRT1-205ENST00000473922 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.39■■■■■ 4.86
SIRT1-205ENST00000473922 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.15■■■■■ 4.82
SIRT1-205ENST00000473922 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.88■■■■■ 4.78
SIRT1-205ENST00000473922 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.71■■■■■ 4.75
SIRT1-205ENST00000473922 SMARCA4P51532 1647 aa44.71■■■■■ 4.75
SIRT1-205ENST00000473922 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.43■■■■■ 4.7
SIRT1-205ENST00000473922 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.43■■■■■ 4.7
SIRT1-205ENST00000473922 NCAPD3P42695 1498 aa44.42■■■■■ 4.7
SIRT1-205ENST00000473922 SMARCA2P51531 1590 aa44.41■■■■■ 4.7
SIRT1-205ENST00000473922 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.31■■■■■ 4.68
SIRT1-205ENST00000473922 HMGXB3Q12766 1538 aa44.19■■■■■ 4.66
SIRT1-205ENST00000473922 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
SIRT1-205ENST00000473922 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
SIRT1-205ENST00000473922 WIZO95785 1651 aa43.96■■■■■ 4.63
SIRT1-205ENST00000473922 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
SIRT1-205ENST00000473922 NESP48681 1621 aa43.22■■■■■ 4.51
SIRT1-205ENST00000473922 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.2■■■■■ 4.51
SIRT1-205ENST00000473922 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.13■■■■■ 4.49
SIRT1-205ENST00000473922 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.02■■■■■ 4.48
SIRT1-205ENST00000473922 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
SIRT1-205ENST00000473922 ERCC6Q03468 1493 aa43■■■■■ 4.47
SIRT1-205ENST00000473922 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.92■■■■■ 4.46
SIRT1-205ENST00000473922 CFTRP13569 1480 aa42.9■■■■■ 4.46
SIRT1-205ENST00000473922 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.72■■■■■ 4.43
SIRT1-205ENST00000473922 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.59■■■■■ 4.41
SIRT1-205ENST00000473922 PRDM2Q13029 1718 aa42.57■■■■■ 4.4
SIRT1-205ENST00000473922 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
SIRT1-205ENST00000473922 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.53■■■■■ 4.4
SIRT1-205ENST00000473922 CUX2O14529 1486 aa42.52■■■■■ 4.4
SIRT1-205ENST00000473922 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.43■■■■■ 4.38
SIRT1-205ENST00000473922 WDR62O43379 1518 aa42.28■■■■■ 4.36
SIRT1-205ENST00000473922 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
SIRT1-205ENST00000473922 ABCC8Q09428 1581 aa42.01■■■■■ 4.32
SIRT1-205ENST00000473922 TOPBP1Q92547 1522 aa41.93■■■■■ 4.3
SIRT1-205ENST00000473922 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.91■■■■■ 4.3
SIRT1-205ENST00000473922 CUX1P39880 1505 aa41.67■■■■■ 4.26
SIRT1-205ENST00000473922 IFT140Q96RY7 1462 aa41.65■■■■■ 4.26
SIRT1-205ENST00000473922 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
SIRT1-205ENST00000473922 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.5■■■■■ 4.23
SIRT1-205ENST00000473922 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.5■■■■■ 4.23
SIRT1-205ENST00000473922 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
SIRT1-205ENST00000473922 SOGA1O94964 1423 aa41.45■■■■■ 4.23
SIRT1-205ENST00000473922 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
SIRT1-205ENST00000473922 TOP2BQ02880 1626 aa41.39■■■■■ 4.22
SIRT1-205ENST00000473922 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.39■■■■■ 4.22
SIRT1-205ENST00000473922 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.38■■■■■ 4.21
SIRT1-205ENST00000473922 SYNJ1O43426 1573 aa41.34■■■■■ 4.21
SIRT1-205ENST00000473922 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
SIRT1-205ENST00000473922 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.21■■■■■ 4.19
SIRT1-205ENST00000473922 WDR97A6NE52 1622 aa41.2■■■■■ 4.19
SIRT1-205ENST00000473922 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
SIRT1-205ENST00000473922 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.14■■■■■ 4.18
SIRT1-205ENST00000473922 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.03■■■■■ 4.16
SIRT1-205ENST00000473922 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.96■■■■■ 4.15
SIRT1-205ENST00000473922 GRIN2BQ13224 1484 aa40.94■■■■■ 4.14
SIRT1-205ENST00000473922 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.93■■■■■ 4.14
SIRT1-205ENST00000473922 PBRM1Q86U86 1689 aa40.83■■■■■ 4.13
SIRT1-205ENST00000473922 OSCARQ8IYS5 282 aa40.83■■■■■ 4.13
SIRT1-205ENST00000473922 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.82■■■■■ 4.12
SIRT1-205ENST00000473922 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
SIRT1-205ENST00000473922 CHD1O14646 1710 aa40.69■■■■■ 4.1
SIRT1-205ENST00000473922 FBLN2P98095 1184 aa40.68■■■■■ 4.1
SIRT1-205ENST00000473922 TRIM41Q8WV44 630 aa40.67■■■■■ 4.1
SIRT1-205ENST00000473922 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.66■■■■■ 4.1
SIRT1-205ENST00000473922 SYNJ2O15056 1496 aa40.65■■■■■ 4.1
SIRT1-205ENST00000473922 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
SIRT1-205ENST00000473922 KIF27Q86VH2 1401 aa40.64■■■■■ 4.1
SIRT1-205ENST00000473922 ADAMTS12P58397 1594 aa40.52■■■■■ 4.08
SIRT1-205ENST00000473922 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.51■■■■■ 4.08
SIRT1-205ENST00000473922 IGF1RP08069 1367 aa40.46■■■■■ 4.07
SIRT1-205ENST00000473922 GRIN2AQ12879 1464 aa40.39■■■■■ 4.06
SIRT1-205ENST00000473922 CUL7Q14999 1698 aa40.31■■■■■ 4.04
SIRT1-205ENST00000473922 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.29■■■■■ 4.04
SIRT1-205ENST00000473922 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.27■■■■■ 4.04
SIRT1-205ENST00000473922 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.26■■■■■ 4.04
SIRT1-205ENST00000473922 NUP160Q12769 1436 aa40.22■■■■■ 4.03
SIRT1-205ENST00000473922 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.22■■■■■ 4.03
SIRT1-205ENST00000473922 CEP170Q5SW79 1584 aa40.16■■■■■ 4.02
SIRT1-205ENST00000473922 ARHGEF11O15085 1522 aa40.1■■■■■ 4.01
SIRT1-205ENST00000473922 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.07■■■■■ 4.01
SIRT1-205ENST00000473922 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.07■■■■■ 4.01
SIRT1-205ENST00000473922 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.07■■■■■ 4.01
SIRT1-205ENST00000473922 EEA1Q15075 1411 aa40■■■■□ 3.99
SIRT1-205ENST00000473922 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40■■■■□ 3.99
SIRT1-205ENST00000473922 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.93■■■■□ 3.98
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