RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-222ENST00000533362 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.91■■■■■ 6.22
PUF60-222ENST00000533362 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.89■■■■■ 5.26
PUF60-222ENST00000533362 ABCC9O60706 1549 aa46.44■■■■■ 5.02
PUF60-222ENST00000533362 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
PUF60-222ENST00000533362 NACADO15069 1562 aa44.94■■■■■ 4.79
PUF60-222ENST00000533362 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.93■■■■■ 4.78
PUF60-222ENST00000533362 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.85■■■■■ 4.77
PUF60-222ENST00000533362 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.8■■■■■ 4.76
PUF60-222ENST00000533362 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.7■■■■■ 4.75
PUF60-222ENST00000533362 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.78■■■■■ 4.6
PUF60-222ENST00000533362 SCRIBQ14160 1630 aa43.62■■■■■ 4.57
PUF60-222ENST00000533362 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.42■■■■■ 4.54
PUF60-222ENST00000533362 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.39■■■■■ 4.54
PUF60-222ENST00000533362 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.22■■■■■ 4.51
PUF60-222ENST00000533362 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
PUF60-222ENST00000533362 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.21■■■■■ 4.35
PUF60-222ENST00000533362 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.05■■■■■ 4.32
PUF60-222ENST00000533362 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.86■■■■■ 4.29
PUF60-222ENST00000533362 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
PUF60-222ENST00000533362 SMARCA4P51532 1647 aa41.77■■■■■ 4.28
PUF60-222ENST00000533362 SMARCA2P51531 1590 aa41.51■■■■■ 4.24
PUF60-222ENST00000533362 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.49■■■■■ 4.23
PUF60-222ENST00000533362 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.46■■■■■ 4.23
PUF60-222ENST00000533362 NCAPD3P42695 1498 aa41.42■■■■■ 4.22
PUF60-222ENST00000533362 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.4■■■■■ 4.22
PUF60-222ENST00000533362 HMGXB3Q12766 1538 aa41.29■■■■■ 4.2
PUF60-222ENST00000533362 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
PUF60-222ENST00000533362 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
PUF60-222ENST00000533362 WIZO95785 1651 aa41.06■■■■■ 4.16
PUF60-222ENST00000533362 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
PUF60-222ENST00000533362 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.33■■■■■ 4.05
PUF60-222ENST00000533362 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
PUF60-222ENST00000533362 NESP48681 1621 aa40.23■■■■■ 4.03
PUF60-222ENST00000533362 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.23■■■■■ 4.03
PUF60-222ENST00000533362 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.18■■■■■ 4.02
PUF60-222ENST00000533362 ERCC6Q03468 1493 aa40.11■■■■■ 4.01
PUF60-222ENST00000533362 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.06■■■■■ 4
PUF60-222ENST00000533362 CFTRP13569 1480 aa40.05■■■■■ 4
PUF60-222ENST00000533362 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.82■■■■□ 3.96
PUF60-222ENST00000533362 PRDM2Q13029 1718 aa39.82■■■■□ 3.96
PUF60-222ENST00000533362 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.76■■■■□ 3.96
PUF60-222ENST00000533362 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.73■■■■□ 3.95
PUF60-222ENST00000533362 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
PUF60-222ENST00000533362 CUX2O14529 1486 aa39.6■■■■□ 3.93
PUF60-222ENST00000533362 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.6■■■■□ 3.93
PUF60-222ENST00000533362 WDR62O43379 1518 aa39.45■■■■□ 3.91
PUF60-222ENST00000533362 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
PUF60-222ENST00000533362 ABCC8Q09428 1581 aa39.28■■■■□ 3.88
PUF60-222ENST00000533362 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.17■■■■□ 3.86
PUF60-222ENST00000533362 TOPBP1Q92547 1522 aa39.14■■■■□ 3.86
PUF60-222ENST00000533362 CUX1P39880 1505 aa38.93■■■■□ 3.82
PUF60-222ENST00000533362 IFT140Q96RY7 1462 aa38.9■■■■□ 3.82
PUF60-222ENST00000533362 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.85■■■■□ 3.81
PUF60-222ENST00000533362 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
PUF60-222ENST00000533362 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.78■■■■□ 3.8
PUF60-222ENST00000533362 TOP2BQ02880 1626 aa38.74■■■■□ 3.79
PUF60-222ENST00000533362 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.73■■■■□ 3.79
PUF60-222ENST00000533362 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
PUF60-222ENST00000533362 SOGA1O94964 1423 aa38.68■■■■□ 3.78
PUF60-222ENST00000533362 SYNJ1O43426 1573 aa38.68■■■■□ 3.78
PUF60-222ENST00000533362 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.6■■■■□ 3.77
PUF60-222ENST00000533362 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
PUF60-222ENST00000533362 WDR97A6NE52 1622 aa38.55■■■■□ 3.76
PUF60-222ENST00000533362 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
PUF60-222ENST00000533362 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.45■■■■□ 3.75
PUF60-222ENST00000533362 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.4■■■■□ 3.741e-12■■■■■ 58
PUF60-222ENST00000533362 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
PUF60-222ENST00000533362 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.26■■■■□ 3.72
PUF60-222ENST00000533362 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.26■■■■□ 3.71
PUF60-222ENST00000533362 GRIN2BQ13224 1484 aa38.24■■■■□ 3.71
PUF60-222ENST00000533362 PBRM1Q86U86 1689 aa38.16■■■■□ 3.7
PUF60-222ENST00000533362 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
PUF60-222ENST00000533362 TRIM41Q8WV44 630 aa38.11■■■■□ 3.69
PUF60-222ENST00000533362 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.1■■■■□ 3.69
PUF60-222ENST00000533362 KIF27Q86VH2 1401 aa38.05■■■■□ 3.68
PUF60-222ENST00000533362 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.03■■■■□ 3.68
PUF60-222ENST00000533362 SYNJ2O15056 1496 aa37.96■■■■□ 3.67
PUF60-222ENST00000533362 OSCARQ8IYS5 282 aa37.96■■■■□ 3.67
PUF60-222ENST00000533362 CHD1O14646 1710 aa37.94■■■■□ 3.66
PUF60-222ENST00000533362 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.93■■■■□ 3.66
PUF60-222ENST00000533362 FBLN2P98095 1184 aa37.91■■■■□ 3.66
PUF60-222ENST00000533362 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
PUF60-222ENST00000533362 ADAMTS12P58397 1594 aa37.89■■■■□ 3.66
PUF60-222ENST00000533362 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.86■■■■□ 3.65
PUF60-222ENST00000533362 CUL7Q14999 1698 aa37.77■■■■□ 3.64
PUF60-222ENST00000533362 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.76■■■■□ 3.64
PUF60-222ENST00000533362 IGF1RP08069 1367 aa37.76■■■■□ 3.64
PUF60-222ENST00000533362 GRIN2AQ12879 1464 aa37.73■■■■□ 3.63
PUF60-222ENST00000533362 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.61■■■■□ 3.61
PUF60-222ENST00000533362 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.58■■■■□ 3.61
PUF60-222ENST00000533362 EEA1Q15075 1411 aa37.57■■■■□ 3.6
PUF60-222ENST00000533362 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.56■■■■□ 3.6
PUF60-222ENST00000533362 NUP160Q12769 1436 aa37.54■■■■□ 3.6
PUF60-222ENST00000533362 CEP170Q5SW79 1584 aa37.48■■■■□ 3.59
PUF60-222ENST00000533362 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.43■■■■□ 3.58
PUF60-222ENST00000533362 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.36■■■■□ 3.57
PUF60-222ENST00000533362 PRXQ9BXM0 1461 aa37.33■■■■□ 3.57
PUF60-222ENST00000533362 ARHGEF11O15085 1522 aa37.33■■■■□ 3.57
PUF60-222ENST00000533362 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
PUF60-222ENST00000533362 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
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