Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX2Q02962 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX2Q02962 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms