Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms