Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNAP02545 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNAP02545 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNAP02545 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNAP02545 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNAP02545 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNAP02545 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNAP02545 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNAP02545 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNAP02545 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNAP02545 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNAP02545 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNAP02545 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNAP02545 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNAP02545 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNAP02545 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNAP02545 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNAP02545 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNAP02545 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNAP02545 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNAP02545 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNAP02545 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNAP02545 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNAP02545 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNAP02545 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNAP02545 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNAP02545 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNAP02545 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNAP02545 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNAP02545 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNAP02545 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNAP02545 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNAP02545 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNAP02545 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNAP02545 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNAP02545 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNAP02545 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LMNAP02545 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNAP02545 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNAP02545 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms