Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSEN34Q9BSV6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSEN34Q9BSV6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSEN34Q9BSV6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSEN34Q9BSV6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSEN34Q9BSV6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSEN34Q9BSV6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSEN34Q9BSV6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSEN34Q9BSV6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSEN34Q9BSV6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms