Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RRAGBQ5VZM2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRAGBQ5VZM2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms