Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAPC2Q13487 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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