Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3AQ05086 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms