Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SPAG9O60271 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SPAG9O60271 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SPAG9O60271 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SPAG9O60271 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SPAG9O60271 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SPAG9O60271 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms