Protein–RNA interactions for Protein: A6NKU9

SPDYE3, Speedy protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE3A6NKU9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPDYE3A6NKU9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE3A6NKU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE3A6NKU9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms