Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38BQ5VTL8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38BQ5VTL8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF38BQ5VTL8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms