RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430267.2

GPR35-204, Transcript of G protein-coupled receptor 35, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GPR35, Length 1,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35-204ENST00000430267 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.88■■■■■ 6.06
GPR35-204ENST00000430267 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.27■■■■■ 5.16
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GPR35-204ENST00000430267 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.44■■■■■ 4.7
GPR35-204ENST00000430267 NACADO15069 1562 aa44.38■■■■■ 4.69
GPR35-204ENST00000430267 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.15■■■■■ 4.66
GPR35-204ENST00000430267 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
GPR35-204ENST00000430267 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.88■■■■■ 4.61
GPR35-204ENST00000430267 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.84■■■■■ 4.61
GPR35-204ENST00000430267 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.56■■■■■ 4.56
GPR35-204ENST00000430267 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.11■■■■■ 4.49
GPR35-204ENST00000430267 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.89■■■■■ 4.469e-7■■■□□ 16.2
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GPR35-204ENST00000430267 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.77■■■■■ 4.44
GPR35-204ENST00000430267 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.35■■■■■ 4.37
GPR35-204ENST00000430267 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
GPR35-204ENST00000430267 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.81■■■■■ 4.28
GPR35-204ENST00000430267 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.46■■■■■ 4.23
GPR35-204ENST00000430267 SMARCA4P51532 1647 aa41.11■■■■■ 4.17
GPR35-204ENST00000430267 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
GPR35-204ENST00000430267 NCAPD3P42695 1498 aa40.89■■■■■ 4.14
GPR35-204ENST00000430267 SMARCA2P51531 1590 aa40.87■■■■■ 4.13
GPR35-204ENST00000430267 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.85■■■■■ 4.13
GPR35-204ENST00000430267 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.81■■■■■ 4.12
GPR35-204ENST00000430267 HMGXB3Q12766 1538 aa40.76■■■■■ 4.12
GPR35-204ENST00000430267 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.69■■■■■ 4.1
GPR35-204ENST00000430267 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
GPR35-204ENST00000430267 WIZO95785 1651 aa40.28■■■■■ 4.04
GPR35-204ENST00000430267 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
GPR35-204ENST00000430267 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.9■■■■□ 3.98
GPR35-204ENST00000430267 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
GPR35-204ENST00000430267 NESP48681 1621 aa39.85■■■■□ 3.97
GPR35-204ENST00000430267 ERCC6Q03468 1493 aa39.73■■■■□ 3.95
GPR35-204ENST00000430267 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.61■■■■□ 3.93
GPR35-204ENST00000430267 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.53■■■■□ 3.92
GPR35-204ENST00000430267 CUX2O14529 1486 aa39.52■■■■□ 3.92
GPR35-204ENST00000430267 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.52■■■■□ 3.92
GPR35-204ENST00000430267 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
GPR35-204ENST00000430267 CFTRP13569 1480 aa39.42■■■■□ 3.9
GPR35-204ENST00000430267 PRDM2Q13029 1718 aa39.33■■■■□ 3.89
GPR35-204ENST00000430267 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.32■■■■□ 3.88
GPR35-204ENST00000430267 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.17■■■■□ 3.86
GPR35-204ENST00000430267 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.16■■■■□ 3.86
GPR35-204ENST00000430267 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.15■■■■□ 3.86
GPR35-204ENST00000430267 WDR62O43379 1518 aa39.1■■■■□ 3.85
GPR35-204ENST00000430267 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
GPR35-204ENST00000430267 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
GPR35-204ENST00000430267 ABCC8Q09428 1581 aa38.61■■■■□ 3.77
GPR35-204ENST00000430267 TOPBP1Q92547 1522 aa38.55■■■■□ 3.76
GPR35-204ENST00000430267 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.55■■■■□ 3.76
GPR35-204ENST00000430267 IFT140Q96RY7 1462 aa38.35■■■■□ 3.73
GPR35-204ENST00000430267 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.33■■■■□ 3.73
GPR35-204ENST00000430267 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
GPR35-204ENST00000430267 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
GPR35-204ENST00000430267 CUX1P39880 1505 aa38.21■■■■□ 3.71
GPR35-204ENST00000430267 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
GPR35-204ENST00000430267 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
GPR35-204ENST00000430267 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.07■■■■□ 3.69
GPR35-204ENST00000430267 WDR97A6NE52 1622 aa38.04■■■■□ 3.68
GPR35-204ENST00000430267 SOGA1O94964 1423 aa37.97■■■■□ 3.67
GPR35-204ENST00000430267 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.96■■■■□ 3.67
GPR35-204ENST00000430267 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.95■■■■□ 3.67
GPR35-204ENST00000430267 TOP2BQ02880 1626 aa37.91■■■■□ 3.66
GPR35-204ENST00000430267 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.86■■■■□ 3.65
GPR35-204ENST00000430267 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.85■■■■□ 3.659e-6■■□□□ 13.1
GPR35-204ENST00000430267 SYNJ1O43426 1573 aa37.83■■■■□ 3.65
GPR35-204ENST00000430267 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.76■■■■□ 3.64
GPR35-204ENST00000430267 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
GPR35-204ENST00000430267 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.69■■■■□ 3.62
GPR35-204ENST00000430267 CHD1O14646 1710 aa37.68■■■■□ 3.62
GPR35-204ENST00000430267 OSCARQ8IYS5 282 aa37.68■■■■□ 3.62
GPR35-204ENST00000430267 PBRM1Q86U86 1689 aa37.66■■■■□ 3.62
GPR35-204ENST00000430267 GRIN2BQ13224 1484 aa37.62■■■■□ 3.61
GPR35-204ENST00000430267 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
GPR35-204ENST00000430267 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.59■■■■□ 3.61
GPR35-204ENST00000430267 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.56■■■■□ 3.6
GPR35-204ENST00000430267 SYNJ2O15056 1496 aa37.42■■■■□ 3.58
GPR35-204ENST00000430267 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.34■■■■□ 3.57
GPR35-204ENST00000430267 ADAMTS12P58397 1594 aa37.31■■■■□ 3.56
GPR35-204ENST00000430267 FBLN2P98095 1184 aa37.27■■■■□ 3.56
GPR35-204ENST00000430267 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.26■■■■□ 3.56
GPR35-204ENST00000430267 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.24■■■■□ 3.55
GPR35-204ENST00000430267 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.24■■■■□ 3.55
GPR35-204ENST00000430267 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.24■■■■□ 3.55
GPR35-204ENST00000430267 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
GPR35-204ENST00000430267 ARHGEF11O15085 1522 aa37.19■■■■□ 3.54
GPR35-204ENST00000430267 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.16■■■■□ 3.54
GPR35-204ENST00000430267 GRIN2AQ12879 1464 aa37.15■■■■□ 3.54
GPR35-204ENST00000430267 KIF27Q86VH2 1401 aa37.08■■■■□ 3.53
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GPR35-204ENST00000430267 NUP160Q12769 1436 aa37.02■■■■□ 3.52
GPR35-204ENST00000430267 CEP170Q5SW79 1584 aa37■■■■□ 3.51
GPR35-204ENST00000430267 IGF1RP08069 1367 aa36.91■■■■□ 3.5
GPR35-204ENST00000430267 SHROOM2Q13796 1616 aa36.87■■■■□ 3.49
GPR35-204ENST00000430267 ARAP1Q96P48 1450 aa36.86■■■■□ 3.49
GPR35-204ENST00000430267 TRIM41Q8WV44 630 aa36.83■■■■□ 3.49
GPR35-204ENST00000430267 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.79■■■■□ 3.48
GPR35-204ENST00000430267 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.68■■■■□ 3.46
GPR35-204ENST00000430267 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.65■■■■□ 3.46
GPR35-204ENST00000430267 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.62■■■■□ 3.45
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