RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628044.1

PFKL-212, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PFKL, Length 129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-212ENST00000628044 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.89■■■■■ 5.74
PFKL-212ENST00000628044 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.51■■■■■ 4.88
PFKL-212ENST00000628044 ABCC9O60706 1549 aa45.31■■■■■ 4.84
PFKL-212ENST00000628044 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.25■■■■■ 4.51
PFKL-212ENST00000628044 NACADO15069 1562 aa43.01■■■■■ 4.48
PFKL-212ENST00000628044 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.98■■■■■ 4.47
PFKL-212ENST00000628044 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.51■■■■■ 4.39
PFKL-212ENST00000628044 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.363e-7■□□□□ 10.7
PFKL-212ENST00000628044 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
PFKL-212ENST00000628044 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.19■■■■■ 4.34
PFKL-212ENST00000628044 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.08■■■■■ 4.33
PFKL-212ENST00000628044 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.05■■■■■ 4.32
PFKL-212ENST00000628044 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.88■■■■■ 4.29
PFKL-212ENST00000628044 SCRIBQ14160 1630 aa41.52■■■■■ 4.24
PFKL-212ENST00000628044 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.47■■■■■ 4.23
PFKL-212ENST00000628044 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
PFKL-212ENST00000628044 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.89■■■■■ 4.14
PFKL-212ENST00000628044 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.81■■■■■ 4.12
PFKL-212ENST00000628044 NCAPD3P42695 1498 aa39.71■■■■□ 3.95
PFKL-212ENST00000628044 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.62■■■■□ 3.93
PFKL-212ENST00000628044 SMARCA4P51532 1647 aa39.62■■■■□ 3.93
PFKL-212ENST00000628044 SMARCA2P51531 1590 aa39.56■■■■□ 3.92
PFKL-212ENST00000628044 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
PFKL-212ENST00000628044 HMGXB3Q12766 1538 aa39.43■■■■□ 3.9
PFKL-212ENST00000628044 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
PFKL-212ENST00000628044 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.22■■■■□ 3.87
PFKL-212ENST00000628044 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.19■■■■□ 3.86
PFKL-212ENST00000628044 ERCC6Q03468 1493 aa39.17■■■■□ 3.86
PFKL-212ENST00000628044 NESP48681 1621 aa38.96■■■■□ 3.83
PFKL-212ENST00000628044 CUX2O14529 1486 aa38.95■■■■□ 3.83
PFKL-212ENST00000628044 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.76■■■■□ 3.8
PFKL-212ENST00000628044 WIZO95785 1651 aa38.7■■■■□ 3.79
PFKL-212ENST00000628044 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.62■■■■□ 3.77
PFKL-212ENST00000628044 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.61■■■■□ 3.77
PFKL-212ENST00000628044 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.55■■■■□ 3.76
PFKL-212ENST00000628044 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
PFKL-212ENST00000628044 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
PFKL-212ENST00000628044 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.41■■■■□ 3.74
PFKL-212ENST00000628044 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
PFKL-212ENST00000628044 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.22■■■■□ 3.71
PFKL-212ENST00000628044 CFTRP13569 1480 aa38.14■■■■□ 3.7
PFKL-212ENST00000628044 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.14■■■■□ 3.7
PFKL-212ENST00000628044 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.1■■■■□ 3.69
PFKL-212ENST00000628044 WDR62O43379 1518 aa38.07■■■■□ 3.68
PFKL-212ENST00000628044 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.86■■■■□ 3.65
PFKL-212ENST00000628044 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
PFKL-212ENST00000628044 PRDM2Q13029 1718 aa37.65■■■■□ 3.62
PFKL-212ENST00000628044 TOPBP1Q92547 1522 aa37.38■■■■□ 3.57
PFKL-212ENST00000628044 ABCC8Q09428 1581 aa37.38■■■■□ 3.57
PFKL-212ENST00000628044 IFT140Q96RY7 1462 aa37.36■■■■□ 3.57
PFKL-212ENST00000628044 OSCARQ8IYS5 282 aa37.28■■■■□ 3.56
PFKL-212ENST00000628044 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.27■■■■□ 3.56
PFKL-212ENST00000628044 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
PFKL-212ENST00000628044 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
PFKL-212ENST00000628044 TRIM41Q8WV44 630 aa37.1■■■■□ 3.53
PFKL-212ENST00000628044 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
PFKL-212ENST00000628044 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
PFKL-212ENST00000628044 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
PFKL-212ENST00000628044 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.94■■■■□ 3.5
PFKL-212ENST00000628044 SOGA1O94964 1423 aa36.9■■■■□ 3.5
PFKL-212ENST00000628044 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.88■■■■□ 3.49
PFKL-212ENST00000628044 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.84■■■■□ 3.49
PFKL-212ENST00000628044 CUX1P39880 1505 aa36.82■■■■□ 3.48
PFKL-212ENST00000628044 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
PFKL-212ENST00000628044 FBLN2P98095 1184 aa36.75■■■■□ 3.47
PFKL-212ENST00000628044 WDR97A6NE52 1622 aa36.68■■■■□ 3.46
PFKL-212ENST00000628044 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
PFKL-212ENST00000628044 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
PFKL-212ENST00000628044 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
PFKL-212ENST00000628044 CHD1O14646 1710 aa36.63■■■■□ 3.45
PFKL-212ENST00000628044 ARHGEF11O15085 1522 aa36.59■■■■□ 3.45
PFKL-212ENST00000628044 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.58■■■■□ 3.45
PFKL-212ENST00000628044 GRIN2BQ13224 1484 aa36.55■■■■□ 3.44
PFKL-212ENST00000628044 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
PFKL-212ENST00000628044 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
PFKL-212ENST00000628044 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.45■■■■□ 3.43
PFKL-212ENST00000628044 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.44■■■■□ 3.42
PFKL-212ENST00000628044 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.42
PFKL-212ENST00000628044 SYNJ2O15056 1496 aa36.39■■■■□ 3.42
PFKL-212ENST00000628044 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.38■■■■□ 3.41
PFKL-212ENST00000628044 SYNJ1O43426 1573 aa36.33■■■■□ 3.41
PFKL-212ENST00000628044 TOP2BQ02880 1626 aa36.31■■■■□ 3.4
PFKL-212ENST00000628044 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.31■■■■□ 3.4
PFKL-212ENST00000628044 PBRM1Q86U86 1689 aa36.31■■■■□ 3.4
PFKL-212ENST00000628044 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.27■■■■□ 3.4
PFKL-212ENST00000628044 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.27■■■■□ 3.4
PFKL-212ENST00000628044 ARAP1Q96P48 1450 aa36.24■■■■□ 3.39
PFKL-212ENST00000628044 GRIN2AQ12879 1464 aa36.06■■■■□ 3.36
PFKL-212ENST00000628044 ADAMTS12P58397 1594 aa36.04■■■■□ 3.36
PFKL-212ENST00000628044 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.01■■■■□ 3.36
PFKL-212ENST00000628044 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.99■■■■□ 3.35
PFKL-212ENST00000628044 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
PFKL-212ENST00000628044 NUP160Q12769 1436 aa35.91■■■■□ 3.34
PFKL-212ENST00000628044 CEP170Q5SW79 1584 aa35.86■■■■□ 3.33
PFKL-212ENST00000628044 KIF27Q86VH2 1401 aa35.7■■■■□ 3.31
PFKL-212ENST00000628044 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.69■■■■□ 3.3
PFKL-212ENST00000628044 SHROOM2Q13796 1616 aa35.66■■■■□ 3.3
PFKL-212ENST00000628044 IGF1RP08069 1367 aa35.61■■■■□ 3.29
PFKL-212ENST00000628044 JPH4Q96JJ6 628 aa35.59■■■■□ 3.29
PFKL-212ENST00000628044 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
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