Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHROOM2Q13796 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SHROOM2Q13796 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
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