RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.58■■■■■ 5.85
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCC9O60706 1549 aa47■■■■■ 5.11
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.51■■■■■ 5.04
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.78■■■■■ 4.76
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.53■■■■■ 4.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NACADO15069 1562 aa44.14■■■■■ 4.66
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.66■■■■■ 4.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.55■■■■■ 4.56
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.51■■■■■ 4.56
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.48■■■■■ 4.55
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.35■■■■■ 4.53
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.74■■■■■ 4.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.66■■■■■ 4.42
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.48■■■■■ 4.39
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.44■■■■■ 4.38
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SCRIBQ14160 1630 aa42.2■■■■■ 4.35
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.57■■■■■ 4.25
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CUX2O14529 1486 aa40.84■■■■■ 4.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NCAPD3P42695 1498 aa40.83■■■■■ 4.13
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ERCC6Q03468 1493 aa40.56■■■■■ 4.08
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.56■■■■■ 4.08
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HMGXB3Q12766 1538 aa40.4■■■■■ 4.06
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SMARCA2P51531 1590 aa40.36■■■■■ 4.05
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SMARCA4P51532 1647 aa40.31■■■■■ 4.04
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NESP48681 1621 aa40.24■■■■■ 4.03
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.05■■■■■ 4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
CDH18-AS1-201ENST00000513573 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.91■■■■□ 3.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.71■■■■□ 3.95
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.69■■■■□ 3.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.66■■■■□ 3.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.5■■■■□ 3.91
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.36■■■■□ 3.89
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WDR62O43379 1518 aa39.33■■■■□ 3.89
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRIM41Q8WV44 630 aa39.23■■■■□ 3.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WIZO95785 1651 aa39.14■■■■□ 3.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.05■■■■□ 3.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.98■■■■□ 3.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CFTRP13569 1480 aa38.95■■■■□ 3.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OSCARQ8IYS5 282 aa38.86■■■■□ 3.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRDM2Q13029 1718 aa38.38■■■■□ 3.74
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.38■■■■□ 3.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.38■■■■□ 3.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.38■■■■□ 3.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IFT140Q96RY7 1462 aa38.35■■■■□ 3.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.24■■■■□ 3.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGEF11O15085 1522 aa38.22■■■■□ 3.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TOPBP1Q92547 1522 aa38.2■■■■□ 3.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCC8Q09428 1581 aa38.11■■■■□ 3.69
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.99■■■■□ 3.67
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.93■■■■□ 3.66
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.9■■■■□ 3.66
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CHD1O14646 1710 aa37.84■■■■□ 3.65
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARAP1Q96P48 1450 aa37.82■■■■□ 3.64
CDH18-AS1-201ENST00000513573 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FBLN2P98095 1184 aa37.63■■■■□ 3.61
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.62■■■■□ 3.61
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SOGA1O94964 1423 aa37.59■■■■□ 3.61
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.61
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WDR97A6NE52 1622 aa37.53■■■■□ 3.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.52■■■■□ 3.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.46■■■■□ 3.59
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.42■■■■□ 3.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SYNJ1O43426 1573 aa37.35■■■■□ 3.57
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GRIN2BQ13224 1484 aa37.33■■■■□ 3.57
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CUX1P39880 1505 aa37.32■■■■□ 3.57
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SYNJ2O15056 1496 aa37.28■■■■□ 3.56
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.1■■■■□ 3.53
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PBRM1Q86U86 1689 aa37.05■■■■□ 3.52
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.03■■■■□ 3.52
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37■■■■□ 3.51
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.84■■■■□ 3.49
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GRIN2AQ12879 1464 aa36.84■■■■□ 3.49
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NUP160Q12769 1436 aa36.81■■■■□ 3.48
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CEP170Q5SW79 1584 aa36.74■■■■□ 3.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADAMTS12P58397 1594 aa36.72■■■■□ 3.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.71■■■■□ 3.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SHROOM2Q13796 1616 aa36.7■■■■□ 3.47
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.64■■■■□ 3.46
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TOP2BQ02880 1626 aa36.57■■■■□ 3.44
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.57■■■■□ 3.44
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.54■■■■□ 3.44
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.47■■■■□ 3.43
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CDH18-AS1-201ENST00000513573 JPH4Q96JJ6 628 aa36.4■■■■□ 3.42
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.5 ms