Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD10P28358 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD10P28358 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD10P28358 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms