Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNAP02545 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNAP02545 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNAP02545 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNAP02545 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNAP02545 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNAP02545 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNAP02545 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNAP02545 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNAP02545 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNAP02545 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNAP02545 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNAP02545 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNAP02545 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNAP02545 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNAP02545 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNAP02545 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNAP02545 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNAP02545 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNAP02545 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNAP02545 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNAP02545 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNAP02545 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNAP02545 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMNAP02545 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNAP02545 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNAP02545 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNAP02545 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNAP02545 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNAP02545 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNAP02545 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNAP02545 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNAP02545 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNAP02545 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNAP02545 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNAP02545 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNAP02545 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNAP02545 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNAP02545 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNAP02545 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNAP02545 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNAP02545 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNAP02545 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNAP02545 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNAP02545 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNAP02545 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNAP02545 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNAP02545 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNAP02545 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNAP02545 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNAP02545 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNAP02545 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNAP02545 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNAP02545 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNAP02545 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNAP02545 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNAP02545 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNAP02545 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNAP02545 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNAP02545 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNAP02545 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNAP02545 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms